Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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