Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms