Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RNF7Q9UBF6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RNF7Q9UBF6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RNF7Q9UBF6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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