Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms