Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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