Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MIS18AQ9NYP9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms