Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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