Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms