Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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