Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms