Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms