Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms