Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms