Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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FOXQ1Q9C009 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FOXQ1Q9C009 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FOXQ1Q9C009 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FOXQ1Q9C009 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FOXQ1Q9C009 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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FOXQ1Q9C009 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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FOXQ1Q9C009 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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FOXQ1Q9C009 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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FOXQ1Q9C009 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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