Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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