Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms