Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms