Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms