Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD9AQ99638 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms