Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERAC1Q96JX3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms