Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms