Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms