Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms