Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms