Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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LINC00269Q8N2A0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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LINC00269Q8N2A0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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LINC00269Q8N2A0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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LINC00269Q8N2A0 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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LINC00269Q8N2A0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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LINC00269Q8N2A0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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LINC00269Q8N2A0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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LINC00269Q8N2A0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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LINC00269Q8N2A0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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LINC00269Q8N2A0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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LINC00269Q8N2A0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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