Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALYREFQ86V81 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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