Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms