Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms