Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.5 ms