Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms