Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms