Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A19-204ENST00000416858 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC153-202ENST00000415318 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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KRTAP21-3Q3LHN1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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KRTAP21-3Q3LHN1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 OR10K2-201ENST00000314902 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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