Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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