Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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