Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SYPL1Q16563 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SYPL1Q16563 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SYPL1Q16563 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SYPL1Q16563 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SYPL1Q16563 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SYPL1Q16563 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SYPL1Q16563 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SYPL1Q16563 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SYPL1Q16563 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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