Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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GABRA6Q16445 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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GABRA6Q16445 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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GABRA6Q16445 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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GABRA6Q16445 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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GABRA6Q16445 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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