Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CNGA3Q16281 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CNGA3Q16281 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CNGA3Q16281 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CNGA3Q16281 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CNGA3Q16281 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CNGA3Q16281 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CNGA3Q16281 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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