Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms