Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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