Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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