Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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