Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCF4Q15080 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCF4Q15080 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NCF4Q15080 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NCF4Q15080 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NCF4Q15080 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NCF4Q15080 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCF4Q15080 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCF4Q15080 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCF4Q15080 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCF4Q15080 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCF4Q15080 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NCF4Q15080 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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NCF4Q15080 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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NCF4Q15080 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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NCF4Q15080 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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NCF4Q15080 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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NCF4Q15080 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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