Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
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