Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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