Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SEMA3AQ14563 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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