Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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GTF2H2Q13888 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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GTF2H2Q13888 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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