Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.5 ms