Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PEX6Q13608 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PEX6Q13608 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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