Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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C1orf61Q13536 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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C1orf61Q13536 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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C1orf61Q13536 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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C1orf61Q13536 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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C1orf61Q13536 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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