Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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